El videojuego está protagonizado por el joven Rex y una misteriosa chica llamada Pyra, que deben pelear juntos hasta alcanzar la tierra prometida de Elysium. El viaje no va a ser sencillo, pues el camino está plagado de peligrosas criaturas y un ejército de enemigos que van a por todas. Como novedad, en este JRPG encontramos dos tipos de personajes: Blades, que combaten directamente, y Drivers, que están ligados a ellos, y aportan distintas ventajas tácticas.
Como en otras aventuras de rol, es necesario superar misiones y acabar con los enemigos para conseguir los preciados puntos de experiencia con los que mejorar las habilidades especiales de los protagonistas de Xenoblade Chronicles 2.
